Activités d’expertise bactériologique pour le diagnostic de la tuberculose
Les activités d’expertise suivent le logigramme suivant en cas de suspicion de résistance à la rifampicine
- Tout envoi de souche ou de matériel biologique doit respecter la réglementation
- Souche de mycobactérie du complexe tuberculosis
- Identification au sein du complexe tuberculosis quand les caractères culturaux ne sont pas typiques de M. tuberculosis
- Contrôle de sensibilité aux antituberculeux de 1ère ligne en cas de difficulté d’interprétation des résultats des tests faits dans le laboratoire d’origine
- Tests de sensibilité aux antituberculeux de 2ème ligne (kanamycine, amikacine, capréomycine, ethionamide, fluoroquinolones, bédaquiline, linézolide, cyclosérine, délamanide) et au pyrazinamide, en cas de résistance à la rifampicine
- Détection moléculaire de la résistance aux antituberculeux
- à partir d’une souche ou à partir d’un prélèvement dans lequel il y a plusieurs baar/champ (objectif x25, coloration à l’auramine)
- Analyse du gène rpoB quand la souche est suspecte d’être résistante à la rifampicine
- pour les souches MDR, analyse systématique de l’ensemble des gènes identifiés comme étant lié à une résistance antibiotique
En cas de résistance à un antituberculeux de première ligne autre que la rifampicine ou en cas d’intolérance à un antituberculeux de première ligne, les analyses suivent le logigramme suivant
- Epidémiologie moléculaire : comparaison des souches
- Systématique pour tous les cas de tuberculose à bacilles MDR
- En cas de suspicion d’épidémie : en lien étroit avec les enquêtes communautaires ou hospitalières et les ARS, et CLAT
- En cas de suspicion de contamination de laboratoire – l’analyse se fait après discussion approfondie du dossier avec le CNR
Autres activités sur la tuberculose
- RCP traitement des tuberculoses complexes
- Registre des cas de tuberculose MDR ou résistante à la rifampicine
- Surveillance des cas de tuberculoses à bacilles MDR ou de la résistance primaire et acquise
- Recherche (site du Cimi-Paris)