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Les techniques de biologie moléculaire en mycobactériologie – communiqué du 12 avril 2023

Communiqué du Groupe de travail de Mycobactériologie Médicale de la Société Française de Microbiologie et du Centre National de référence des Mycobactéries et de la Résistance des mycobactéries aux antituberculeux – 12/04/2023

sur l’utilisation exclusive des techniques moléculaires pour le diagnostic d’infection à mycobactérie – à lire sur le site de la SFM

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Accès à la rifapentine en Europe

Un groupe de médecins européens, dont des membres du CNR-MyRMA soulève la difficulté d’accès à la rifapentine en Europe pour le traitement des malades tuberculeux

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Réglementation – transport

Envoyer une souche ou un prélèvement au CNR 

L’envoi de souche et/ou prélèvement au CNR doit se faire dans le cadre des missions de celui-ci. Vous pouvez consulter les détails des activités d’expertise microbiologiques (tuberculose, MNT, lèpre) avant envoi. Pour toute demande en dehors de ce cadre, il est nécessaire de contacter le CNR par courriel au préalable.

Une fiche de renseignement doit obligatoirement accompagner tout envoi au CNR. Cette fiche de renseignement doit être remplie aussi complétement et précisément que possible afin de mettre en oeuvre les bonnes techniques et de pouvoir interpréter les résultats. Si besoin, la fiche peut être accompagnée de documents importants pour la compréhension du dossier, tels que résultats antérieurs d’un laboratoire. Pour la lèpre, une fiche et des modalités spécifiques ont à respecter (lien vers la fiche).

Pour rappel, la tuberculose est une maladie à déclaration obligatoire ; si ce n’est déjà fait, penser à faire la e-déclaration (eDO).

Adresse d’envoi

Les souches et/ou prélèvements sont à adresser au CNR à l’adresse suivante :

Laboratoire de Bactériologie-Hygiène 
HU Pitié-Salpêtrière
APHP Sorbonne Université
47-83 boulevard de l’Hôpital
75651 Paris cedex 13
téléphone : +33 1.42.16.20.70
télécopie : +33 1.42.16.20.72
cnrmyrma[a]cnrmyrma.fr
Préparation de l’envoi

Le CNR-MyRMA étant fermé le week-end et jours fériés, merci de bien vouloir expédier les souches et/ou prélèvements de préférence avant le jeudi.

1/ Contrôle de la pureté de la souche avant envoi : n’envoyer que des souches pures afin de limiter les délais de réponse.

2/ Milieux et conditions de transport 

Type d’échantillonMilieu de transportTempérature de transport
Prélèvement clinique hors recherche de lèprePot stérile
(nb : écouvillon refusé)
4°C
Prélèvement clinique à la recherche de lèprevoir fiche spécifique
Souche de mycobactérieMilieu gélosé ou liquideTempérature ambiante
Extrait d’ADN (joindre impérativement le témoin négatif d’extraction)Tube eppendorf vissé et entouré de parafilm ou dans un tube falcon pour éviter les fuites4°C
Acheminement des souches

L’expéditeur prend en charge l’envoi et le transport des souches vers le CNR-MyRMA des mycobactéries ainsi que tous les frais liés à ce transfert. A ce titre, l’expéditeur s’engage à se conformer à la réglementation applicable au transport et à la manipulation de matières infectieuses. L’expéditeur procédera également à l’emballage et l’expédition par le transporteur de son choix des souches dans le respect de la réglementation applicable en France. L’expéditeur sera responsable de tout défaut ou dommage consécutifs à un emballage inadapté.

Tout transport de matériels biologiques potentiellement infectieux demeure sous l’entière responsabilité de l’expéditeur. Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l’arrêté du 5 août 2009 modifiant l’arrêté du 29 mai 2009 elatif au transport des marchandises dangereuses par voies terrestres (dit « arrêté TMD »). Il est recommandé de suivre le Guide sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic publié par l’OMS (voir aussi les liens plus bas).

Des informations sont également disponibles sur le site de la Société Française de Microbiologie (« TRANSPORT DE MATIÈRES INFECTIEUSES »)

Catégorie de matière infectieuseCatégorie ONUType d’emballage
AONU 2814
(= UN 2814)
P620
BONU 3373
(=UN 3373)
P650

D’après l’ONU et l’OMS, les prélèvements suspects de contenir des mycobactéries, tuberculeuses ou non, ainsi que les cultures de mycobactéries non tuberculeuses, peuvent être transportés par route en catégorie B (UN 3373). En revanche, la réglementation impose un transport en catégorie A (UN 2814) pour le transport des souches de M. tuberculosis. Toutefois, d’après les recommandations européennes (ECDC) et françaises (SFM), lorsque les cultures de M. tuberculosis sont envoyées à des fins diagnostiques, elles peuvent être catégorisées B. Ainsi l’ensemble des envois au CNR-MyRMA de prélèvements ou cultures peut être fait en catégorie B.

Information concernant les souches ou d’un échantillon contenant une souche de M. tuberculosis XDR

La réglementation MOT a été modifiée par un arrêté du 26 avril 2023 publié le 28 mai 2023. Les souches de M. tuberculosis complexe ultrarésistantes (XDR) selon la définition OMS antérieure au 31/12/2020 ou la définition postérieure à cette date ne font plus partie de la liste des MOT.

En conséquence, l’envoi de souches XDR doit suivre la même procédure que pour tout envoi de prélèvement ou souche au CNR (catégorie B) comme décrit ci-dessus.

Communications des résultats

Les résultats sont adressés par courrier au laboratoire demandeur de l’analyse. Ces courriers peuvent être multipliés en cas d’analyses multiples nécessaires.

Conditions financières

Les activités du CNR contribuent à la santé publique et sont donc en partie financées par le Ministère en charge de la Santé.

Prestations de conseil, suggestions, réclamations

Contacter le CNR MyRMA par courriel à l’adresse suivante : cnrmyrma[a]cnrmyrma.fr

Les expertises sont faites à titre gracieux lorsque les souches parviennent au CNR dans les conditions requises et sont accompagnées de renseignements contribuant à la connaissance épidémiologique.

Liens utiles
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Membres de la RCP tuberculose

Membres 2023-2024

NomSpécialitéAffiliation
EL ELHALI NadiaPharmacologieHôp. Saint-Joseph
GYDE EstherBactériologieCNR-MyRMA
GUGLIELMETTI LorenzoBactériologieCNR-MyRMA
JACHYM MathildePneumologieCM Bligny
LE DU Damien InfectiologieCM Bligny
MARIGOT DhibaPneumologieCM Bligny
PETERSEN TaniaBactériologieCNR-MyRMA
POIGNON CorentinBactériologieCNR-MyRMA
POURCHER ValérieInfectiologiePitié-Salpêtrière
PREVOST BlandinePédiatrieHôp. Trousseau
THOUVENIN GuillaumePédiatrieHôp. Trousseau
VEZIRIS NicolasBactériologieCNR-MyRMA
WICKY MarieSamu Social

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