Le vendredi 28 mars 2025, la Direction Générale de la Santé, Santé publique France et le Centre National de Référence des mycobactéries et de la Résistance aux Antituberculeux ont organisé la journée nationale d’information et d’échanges sur la tuberculose à Paris.
Vous pouvez trouver les informations, le programme et les présentations sur le site de Santé publique France – ICI
L’envoi de souche et/ou prélèvement au CNR doit se faire dans le cadre des missions de celui-ci. Vous pouvez consulter les détails des activités d’expertise microbiologiques (tuberculose, MNT, lèpre) avant envoi. Pour toute demande en dehors de ce cadre, il est nécessaire de contacter le CNR par courriel au préalable.
Une fiche de renseignement doit obligatoirement accompagner tout envoi au CNR. Cette fiche de renseignement doit être remplie aussi complétement et précisément que possible afin de mettre en oeuvre les bonnes techniques et de pouvoir interpréter les résultats. Si besoin, la fiche peut être accompagnée de documents importants pour la compréhension du dossier, tels que résultats antérieurs d’un laboratoire. Pour la lèpre, une fiche et des modalités spécifiques ont à respecter (lien vers la fiche).
Pour rappel, la tuberculose est une maladie à déclaration obligatoire ; si ce n’est déjà fait, penser à faire la e-déclaration (eDO).
Adresse d’envoi
Les souches et/ou prélèvements sont à adresser au CNR à l’adresse suivante :
Laboratoire de Bactériologie-Hygiène HU Pitié-Salpêtrière APHP Sorbonne Université 47-83 boulevard de l’Hôpital 75651 Paris cedex 13
Extrait d’ADN (joindre impérativement le témoin négatif d’extraction)
Tube eppendorf vissé et entouré de parafilm ou dans un tube falcon pour éviter les fuites
4°C
Acheminement des souches
L’expéditeur prend en charge l’envoi et le transport des souches vers le CNR-MyRMA des mycobactéries ainsi que tous les frais liés à ce transfert. A ce titre, l’expéditeur s’engage à se conformer à la réglementation applicable au transport et à la manipulation de matières infectieuses. L’expéditeur procédera également à l’emballage et l’expédition par le transporteur de son choix des souches dans le respect de la réglementation applicable en France. L’expéditeur sera responsable de tout défaut ou dommage consécutifs à un emballage inadapté.
Tout transport de matériels biologiques potentiellement infectieux demeure sous l’entière responsabilité de l’expéditeur. Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l’arrêté du 5 août 2009 modifiant l’arrêté du 29 mai 2009 elatif au transport des marchandises dangereuses par voies terrestres (dit « arrêté TMD »). Il est recommandé de suivre le Guide sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic publié par l’OMS (voir aussi les liens plus bas).
D’après l’ONU et l’OMS, les prélèvements suspects de contenir des mycobactéries, tuberculeuses ou non, ainsi que les cultures de mycobactéries non tuberculeuses, peuvent être transportés par route en catégorie B (UN 3373). En revanche, la réglementation impose un transport en catégorie A (UN 2814) pour le transport des souches de M. tuberculosis. Toutefois, d’après les recommandations européennes (ECDC) et françaises (SFM), lorsque les cultures de M. tuberculosis sont envoyées à des fins diagnostiques, elles peuvent être catégorisées B. Ainsi l’ensemble des envois au CNR-MyRMA de prélèvements ou cultures peut être fait en catégorie B.
Information concernant les souches ou d’un échantillon contenant une souche de M. tuberculosis XDR
La réglementation MOT a été modifiée par un arrêté du 26 avril 2023 publié le 28 mai 2023. Les souches de M. tuberculosis complexe ultrarésistantes (XDR) selon la définition OMS antérieure au 31/12/2020 ou la définition postérieure à cette date ne font plus partie de la liste des MOT.
En conséquence, l’envoi de souches XDR doit suivre la même procédure que pour tout envoi de prélèvement ou souche au CNR (catégorie B) comme décrit ci-dessus.
Communications des résultats
Les résultats sont adressés par courrier au laboratoire demandeur de l’analyse. Ces courriers peuvent être multipliés en cas d’analyses multiples nécessaires.
Conditions financières
Les activités du CNR contribuent à la santé publique et sont donc en partie financées par le Ministère en charge de la Santé.
Prestations de conseil, suggestions, réclamations
Contacter le CNR MyRMA par courriel à l’adresse suivante : cnrmyrma[a]cnrmyrma.fr
Les expertises sont faites à titre gracieux lorsque les souches parviennent au CNR dans les conditions requises et sont accompagnées de renseignements contribuant à la connaissance épidémiologique.
Identification au sein du complexe tuberculosisquand les caractères culturaux ne sont pas typiques de M. tuberculosis
Contrôle de sensibilité aux antituberculeux de 1ère ligne en cas de difficulté d’interprétation des résultats des tests faits dans le laboratoire d’origine
Tests de sensibilité aux antituberculeux de 2ème ligne (kanamycine, amikacine, capréomycine, ethionamide, fluoroquinolones, bédaquiline, linézolide, cyclosérine, délamanide) et au pyrazinamide, en cas de résistance à la rifampicine
Détection moléculaire de la résistance aux antituberculeux
à partir d’une souche ou à partir d’un prélèvement dans lequel il y a plusieurs baar/champ (objectif x25, coloration à l’auramine)
Analyse du gène rpoBquand la souche est suspecte d’être résistante à la rifampicine
pour les souches MDR, analyse systématique de l’ensemble des gènes identifiés comme étant lié à une résistance antibiotique
En cas de résistance à un antituberculeux de première ligne autre que la rifampicine ou en cas d’intolérance à un antituberculeux de première ligne, les analyses suivent le logigramme suivant
Epidémiologie moléculaire : comparaison des souches
Systématique pour tous les cas de tuberculose à bacilles MDR
En cas de suspicion d’épidémie : en lien étroit avec les enquêtes communautaires ou hospitalières et les ARS, et CLAT
En cas de suspicion de contamination de laboratoire – l’analyse se fait après discussion approfondie du dossier avec le CNR